第一个如前所述图资料库的菌株宏观调控新陈代谢亲密关系科学知识图表,云原生植物Serverless应用应用领域构架......近日,中国科学院青岛轻工业微生物控制技术学术研究院与Amazon云信息技术联手在青岛举办“微生物排序结构设计”沟通交流会,就 BT+IT 助推制备微生物化学产业发展的现状和未来进行沟通交流。
中国科学院青岛轻工业微生物控制技术学术研究院(以下简称青岛轻工业微动物所)是中国制备微生物化学应用领域的核心理念力量,由中国科学院和青岛市人民政府资源共享,组织协调组织承担了多项制备微生物化学、绿色微生物制造等重点研制计划任务统计数据猿了解到,中国科学院青岛轻工业微生物控制技术学术研究院与Amazon云信息技术在微生物排序结构设计应用领域合作已经长达四年之久。
2019年,青岛轻工业微动物所成立了微生物结构设计服务中心平台实验室,并围绕微生物排序结构设计,开始与Amazon云信息技术共同探索微生物控制技术和信息控制崇天(BT+IT)控制技术体系,以更进一步促进制备微生物化学产业发展,以求能为在健康、能源、农业和环境等应用领域的科学学术研究提供更多控制技术支撑。
如今,中国科学院青岛轻工业微生物控制技术学术研究院与Amazon云信息技术联手,透过冲破现代开发模式提升科研效率,快速成果转化,在核心理念资料库和专业应用应用领域辅助工具结构设计两大研制路径上同时实现控制技术冲破,有效率促进了制备微生物化学产业发展如前所述Amazon Neptune图资料库 构筑第一个菌株宏观调控新陈代谢科学知识图表。
细胞核中的新陈代谢宏观调控非常繁杂,一个特定的细胞核机能往往由一系列相同类别的新陈代谢途径宏观调控交互作用决定通常相同类别的宏观调控统计数据布满在各个相同的资料库,微生物化学家很难透过仅关注与所学术研究的新陈前体/蛋白质密切相关的一两类交互作用来识别这种繁杂宏观调控交叉耦合亲密关系。
因此,将这些相同类别的宏观调控交互作用汇集在一起,并提供更多方便的X310e,将极大的方便微生物化学家发掘和理解微有机体内的繁杂宏观调控亲密关系
青岛轻工业微动物所微生物结构设计服务中心项目组联手Amazon云信息技术项目组,在排序微生物化学国际学术期刊《Nucleic Acids Research》(《多肽学术研究》)上撰文,发布了第一个如前所述图资料库Amazon Neptune的菌株宏观调控新陈代谢亲密关系科学知识图表ERMer
,首次提供更多了自上而下的新陈代谢宏观调控图表,并透过建模框架同时实现了丰富的搜索机能,如催化反应查阅、极短路径查阅等ERMer选用专门为高度关联的繁杂统计数据集的高效储存和查阅结构草图资料库构架,这打破了现代的低效率统计Rampur方式,有效率增强用户和图表的交互式,大大增加了使用门槛。
为充分发挥科学知识图表的价值,微生物结构设计服务中心项目组还更进一步选用如前所述图数学模型控制技术进行逻辑推理,成功同时实现了mRNA胺基酸预估和mRNA胺基酸机理预估等机能,这将有助于发掘潜在的关键宏观调控胺基酸和宏观调控机理,构筑捷伊宏观调控新陈代谢网络,能为学术研究人员提供更多捷伊思路和路径。
云原生植物Serverless应用应用领域构架 快速微生物排序结构设计辅助工具研制模组化、技术标准,是所有工程学科的基础,也是制备微生物化学区别于现代发酵行业的革命工程学的可控性,意味着其将能与各种软硬件进行结合,从而走向自动化与高通量,摆脱过往劳动密集型的学术研究模式,获得更高的控制技术迭代能力。
而对于这个过程,除了针对元件辅助工具以外,将制备微生物化学的相关实验流程进行模组化、技术标准,也是自动化学术研究当中不可或缺的一环
Amazon Serverless控制技术栈,使得科研人员不再需要在重复的低价值IT工作上花费精力,而是透过现代化应用应用领域这种理念去同时实现云原生植物构筑,提高整体IT的敏捷性不必管理基础设施,可以更加关注业务逻辑,集中精力于核心理念业务场景。
,快速创新同时在控制技术上,也让开发更加灵活、更加快速的研制交付模式不需要管理服务器,所有的服务器的弹性都是由Amazon云信息技术来做托管,在任何规模下都有很好的性能的表现还可以更细粒度的做应用应用领域的计费,以毫秒级计费。
在没有业务使用的情况下不收费整个过程统计数据安全,无论是统计数据传输过程中还是统计数据储存落地过程中,都可以使用密钥来对统计数据做安全性管控云平台AutoESD并行处理数百个结构设计任务面向微微生物遗传操作,青岛轻工业微动物所微生物结构设计服务中心项目组开发了第一个能在所有操作类别、任何基因组位点和跨物种上进行精确、自动化和高通量编辑序列结构设计的云平台AutoESD。
AutoESD 的开发选用了如前所述云端的无服务器构架,确保了高可靠性、稳健性和可扩展性,能在几分钟内并行处理包含上千个编辑序列结构设计目标的数百个结构设计任务开发人员利用Amazon Step Functions同时实现建模的工作流管理,同时实现了编辑序列结构设计工作流的串联,从而同时实现应用应用领域的快速构筑和更新,同时快速查阅处理异常任务;利用Amazon Lambda将相同的引物结构设计、同源臂结构设计等编辑序列结构设计模块封装打包,满足了具体机能的模组化开发要求,并方便地对机能模块进行管理和共享;利用Amazon DynamoDB提供更多毫秒级的动态资源响应性能,并自动扩展所需资源以应对增加的业务需求。
这些Serverless服务帮助青岛轻工业微动物所项目组更进一步简化运维,使得开发人员可以专注于业务代码和创新,与现代开发方式相比,开发时间缩短了75%,总体拥有成本降低50%Amazon Neptune图资料库同时实现业务创新,解决异质统计数据问题
利用AI能力同时实现进化一方面可以将所有的繁杂的高度关联的统计数据储存在图资料库里面,透过优化的图查阅的语句来解决繁杂的催化反应查阅、极短路径检索等问题另一方面使用Amazon Neptune ML这种高度封装的图深度学习的框架服务,同时实现在低代码或者无代码情况下生成机器学习模型。
Amazon Neptune ML应用应用领域在三类预估任务当中,mRNA胺基酸预估,mRNA胺基酸宏观调控亲密关系预估以及预估蛋白质交互作用的关联预估
Amazon云信息技术认为,统计数据和统计数据之间的亲密关系一样重要,并且这些亲密关系的强度和权重对解决实际问题会有更多的帮助Amazon Neptune图资料库可以储存这些信息,自动化地去做一些统计数据的关联,并且可以透过图算法解决路径、图的优化问题。
“中国科学院青岛轻工业微生物控制技术学术研究院肩负着国家轻工业微生物控制技术产业发展的重任,并正在快速利用云排序促进相关控制技术的研制和成果落地Amazon云信息技术提供更多的图资料库和Serverless服务,冲破现代的开发模式、提升研制效率、不断优化云上成本,微生物控制技术和信息控制崇天的控制技术体系将更进一步促进制备微生物应用领域的产业发展和创新。
”青岛轻工业微生物控制技术学术研究院微生物结构设计服务中心主任马红武表示,未来,青岛轻工业微动物所项目组希望如前所述Amazon云信息技术先进的服务控制技术和能力,开展更多“BT+IT”的研制工作,更进一步助推学术研究院在制备微生物应用领域的科研探索Amazon云信息技术:合作中简化创新 释放云原生植物力量
Amazon云信息技术的云原生植物构架能帮助企业充分利用按需交付、快速拓展部署、弹性和更高级别的服务可以大大提高了开发人员的工作效率、业务敏捷性、可扩展性、可用性、资源利用率和成本节约四年来,Amazon云信息技术与青岛轻工业微动物所合作中从最初的数字服务中心到现在的所有IT构架、开发理念、开发模式都以云原生植物的方式同时实现,合作分为三个阶段:。
第一阶段,学习云排序术,利用Amazon的新型辅助工具进行初步尝试,在云上做构筑凭借Amazon云信息技术的行业经验和云排序的控制技术实力,获取专属的云排序的解决方案和思路,解决如前所述具体场景的控制技术需求第二阶段,合作进入快速产业发展,增加10多个软件应用应用领域的云上部署,尝试构筑云原生植物现代化应用应用领域,探索出更适合微生物结构设计服务中心业务模式的最佳实践。
第三阶段,使用托管服务和创新服务进行云原生植物创新,加大对云排序优势的利用,如按需交付、快速扩展、弹性等,大大提升了开发效率、业务敏捷性、可扩展性和可用性,同时同时实现成本节约在此基础上,Amazon云信息技术总结出合作的最佳实践,对于前端来说,使用Amazon云信息技术提供更多的对象储存来做静态页的托管,同样无需去管理服务器。
对于后端来说,针对于相同的场景,例如小规模的排序任务可以透过Amazon Lambda来做更灵活的调度、更精细化的计费,按照毫秒计费来降低成本对于一些大规模的、繁杂的微生物结构设计的流程,Amazon云信息技术透过Amazon Step Function去管理繁杂任务的逻辑亲密关系,来同时实现自动化的任务调度、编排。
对于大算力需求,有一些微生物的排序过程需要大量的算力,可能需要数百台或者更多,再透过Amazon Batch排序服务去承载更大规模的排序任务除此之外,提供更多的很多监控、管理、部署的服务,可快速地扩展部署到其他业务场景中,代码也可以更好地复用。
Amazon云信息技术中国区商用与公共市场事业部总经理李晓芒表示,“Amazon云信息技术为全球数千家生命科学应用领域客户提供更多云服务和行业解决方案,助推从实验室到真实世界,全面快速生命科学数字化创新我们很高兴能与青岛轻工业微动物所一道,透过云控制技术和深厚的行业实践促进制备微生物化学应用领域的控制技术进步,开拓微生物制造产业的数字化创新路径。
”文:沐清漪 / 统计数据猿
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